生命の仕組み
生命活動は，数万個以上の種類の要素が，設計図であるゲノムに書かれた内容に従って，複雑に関係し合って成立しています．その仕組みは不明な点が多くあります．
特に，生活習慣病を対象として，分子レベルから集団レベルまでの様々な視点による記述と解析を進めています．多種多量の実験データと人工知能を使って状態変化の推測や遺伝子間の関係を予測しています．
人工知能，知識，脳
人工知能と関係が深い脳について，人が思考する際の脳内活動について研究しています．
一方で，様々な分野の知識は，それぞれの分野特有の表現方法や構造を持っています．また，用途に応じて適した方法が異なります．人間が直接把握できない複雑な仕組みや現象をどのように見える形にするか，という問題もあります．さらには，脳内でどのように表現されているのかも未解明の状態です．これらの問題について研究しています．
お笑い，人工知能
お笑いを評価する人工知能システム「owarAI-X」を作り，漫才コンテスト（M-1グランプリ）の決勝戦から最終決戦への進出グループの順位を2年連続で予測することに成功しました．
M-1 グランプリ 2015 の予測
M-1 グランプリ 2016 の予測
「owarAI-X」を使い，漫才コンテスト M1-2019（M-1グランプリ）の優勝者を開催前に予測することに成功しました．
漫才やコントや他のお笑い，ロボットによる漫才も研究対象です．
